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NGS技術(shù)專刊第五期—NGS測(cè)序**步就錯(cuò)了?生物樣本保存運(yùn)輸全攻略!
來(lái)源: | 作者:沃小森 | 發(fā)布時(shí)間: 2025-02-13 | 177 次瀏覽 | 分享到:

NGS技術(shù)??谖迤谏飿颖颈4?amp;運(yùn)輸

拿到樣本后直接扔冰箱?運(yùn)輸時(shí)只用泡沫箱加冰袋?這些操作可能讓你的NGS數(shù)據(jù)“翻車”!樣本保存和運(yùn)輸是測(cè)序成功的**步,但80%的科研人都在這一步踩坑。本期NGS技術(shù)專刊,一文講透血液、組織、核酸等樣本的正確處理姿勢(shì)!

為什么樣本保存運(yùn)輸是NGS的“生死關(guān)”?

NGS技術(shù)雖強(qiáng)大,但“垃圾樣本進(jìn),垃圾數(shù)據(jù)出”!
常見翻車現(xiàn)場(chǎng):

  • 血液樣本溶血導(dǎo)致游離DNA降解

  • 組織樣本反復(fù)凍融,RNA斷成“二維碼”

  • 微生物樣本常溫運(yùn)輸,活菌變死菌
    ……

科學(xué)依據(jù):樣本中的核酸、蛋白質(zhì)或細(xì)胞活性對(duì)溫度、時(shí)間極度敏感,錯(cuò)誤保存會(huì)直接導(dǎo)致:

  • 基因表達(dá)譜失真

  • 微生物多樣性數(shù)據(jù)偏差

  • 低頻突變檢出失敗

超全生物樣本保存&運(yùn)輸指南

1、血液樣本

類型保存方式運(yùn)輸保存期
全血(有核細(xì)胞)4℃EDTA抗凝管冰袋+4℃恒溫箱24h
血漿/血清分離后-80℃凍存(避免反復(fù)凍融)干冰運(yùn)輸1年
游離DNA專用cfDNA保存管常溫7天

推薦:

LAKEbio游離DNA常溫保存管(有注冊(cè)證,貨號(hào):3aB0310.0-100)

2、組織樣本

類型保存方式運(yùn)輸
新鮮組織切割標(biāo)本后置于樣本冷凍保存管中,液氮或者-80℃冰箱保存干冰運(yùn)輸
FFPE樣本常溫保存,建議不超過半年置于固定液常溫運(yùn)輸
冰凍切片-20℃不超過三個(gè)月,-80℃長(zhǎng)期保存干冰運(yùn)輸

3、核酸樣本(DNA/RNA)

類型保存濃度存儲(chǔ)溫度運(yùn)輸
DNA≥50ng/μL-20℃短期冰袋
RNA≥200ng/μL-80℃長(zhǎng)期干冰

推薦:

RNA樣本可添加RNA穩(wěn)定劑

長(zhǎng)期儲(chǔ)存建議分裝至低吸附離心管

麥伯生物1.5ml低吸附離心管(貨號(hào):MT-1.5-S-C-LR)

4、微生物樣本

類型需氧/厭氧保存液運(yùn)輸
腸道菌群厭氧含甘油冷凍保護(hù)劑-80℃干冰
環(huán)境微生物需氧DNA/RNA Shield常溫

關(guān)鍵點(diǎn):

活菌運(yùn)輸需使用轉(zhuǎn)運(yùn)培養(yǎng)基

16S擴(kuò)增子測(cè)序樣本建議-80℃保存以防菌群比例變化

樣本是NGS的“生命之源”,一次正確的保存選擇,可能挽救價(jià)值百萬(wàn)的科研數(shù)據(jù)!

溫馨Tips:

(1)樣本保存要注意標(biāo)記清楚編號(hào)、樣本類型、處理日期、保存條件等。

(2)游離核酸血液樣本雖然是常溫運(yùn)輸,但是面對(duì)極端天氣,要采取相應(yīng)措施:冬季采血管可裝在保溫容器(例如保溫杯)中寄送,注意防撞;夏季,保溫容器先在4℃冰箱預(yù)冷,然后裝采血管寄送,注意防撞。

(3)FFPE樣本常溫運(yùn)輸要注意高溫天氣,采取適當(dāng)降溫措施。


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